肾透明细胞癌关键枢纽基因的筛选及生物信息学分析

来源 :暨南大学学报:自然科学与医学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：l_chuanfei

【摘要】

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目的:旨在通过生物信息学方法筛选与肾透明细胞癌(ccRCC)发生、发展相关的关键枢纽基因.方法:从公共基因数据库下载ccRCC基因芯片数据集(GSE66270)并筛选ccRCC组织与正常癌旁

【作者】

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李灿楦陈洁徐争光林晏廷李晓

【机构】

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暨南大学附属第一医院泌尿外科

【出处】

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暨南大学学报:自然科学与医学版

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

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肾透明细胞癌生物信息学差异表达基因 clear cell renal cell carcinomabioinformaticsdifferentially

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81871155)

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目的:旨在通过生物信息学方法筛选与肾透明细胞癌(ccRCC)发生、发展相关的关键枢纽基因.方法:从公共基因数据库下载ccRCC基因芯片数据集(GSE66270)并筛选ccRCC组织与正常癌旁组织样本间的差异表达基因.R软件的clusterProfiler程序包用于差异表达基因的基因本体(GO)功能注释、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用STRING数据库、Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI)并筛选关键枢纽基因.通过GEPIA数据库对关键枢纽基因进行验证和预后分析.结果:共筛

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