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应用TRAP分子标记方法对65份棉花种质资源进行遗传多样性分析。从100对引物中筛选出10对引物,用TRAP-PCR的方法共扩增出252条带,其中210条为多态带,比率为83.33%。利用NTSYSpc 2.1遗传学统计分析软件中的UPMGA法对所获得的数据进行聚类分析,建立了65份棉花种质资源的亲缘关系树状图。当遗传相似性系数(GS)为0.84时,65份种质资源可以分为6大类群。所获得的聚类结果与种质资源的地域来源和形态特征有一定的相关性。说明TRAP型的分子标记方法在棉花种质资源鉴定、分类等方面的研究上具有良好的应用前景。