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通过三年建设，深圳市疾病预防控制体系不断完善，财政保障不断加强，公共职能逐渐改善，但仍存在职能错位和管理不到位的问题。在新时期，疾病预防控制机构转型是必要的、也是可行的，是构建公共服务型政府和创建和谐社会的需要。要顺利实现疾病预防控制机构转型，必须争取政府的强有力支持，建立财政保障体系，完善配套制度改革，推进项目化管理。