基于转录组测序的脓毒症小鼠脾脏差异表达基因分析

来源 :中国中西医结合外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mzhao79
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目的:研究脂多糖(LPS)诱导的脓毒症小鼠脾脏中mRNA表达变化及特征,寻找影响脓毒症病理生理进程的信号通路。方法:将50只小鼠分成LPS组和Sham组,每组25只,比较两组小鼠存活率及血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6和IL-1β水平。提取脾脏中mRNA,利用转录组测序技术测定基因表达量,随后通过两种富集方法分析:寻找差异表达基因(P<0.05,|log2FoldChange|≥1)进行GO和KEGG分析以及在GSEA v4.0.1软件中富集P <0.05,Q <0.25的基因。RT-qPCR验证10个显著差异表达基因。结果:LPS成功构建脓毒症模型,表现出严重炎症反应和高死亡率。LPS组对比Sham组显著改变的差异表达基因有1 616个,其中下调基因919个,上调基因697个。富集分析涉及多条炎症反应、调控遗传信息、参与信号转导和细胞过程的通路。RT-qPCR验证结果显示10个基因表达趋势与测序结果一致。结论:胞质DNA传感途径可能在脓毒症病理过程中起着重要作用,Zbp1、Ddx58、Cxcl10、Polr1d可能是其发挥功能的重要靶点。
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