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限制性核酸内切酶是一类在DNA分子特定部位的两个脱氧核糖核昔酸之间的磷酸二酯键进行切割的酶,简称限制酶。根据限制酶的结构,辅助因子的需求切位与作用方式,可将限制酶分为Ⅰ、Ⅱ及Ⅲ三种类型。Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解;皿型限制性内切酶同时具有修饰及认知切割的作用。