基于粤港澳大湾区11个城市数据的实证分析表明，“中心城市趋向于服务专业化，而中小城市趋向于制造专业化”的功能分工格局已在粤港澳大湾区城市群内部形成，并正逐步得到强化。通过将粤港澳大湾区各市服务功能专业化指数与全员劳动生产率两个变量进行相关性分析发现，总体而言，粤港澳大湾区功能分工格局有助于提高粤港澳大湾区城市群经济活动的效率，其中，服务功能专业化促进了香港、澳门、广州、珠海、江门和惠州6个城市的经济活动效率，制造功能的强化促进了东莞、肇庆、佛山、深圳和中山5市经济活动效率的提升。基于实证分析结果，未来有必要深化粤港澳大湾区城市群发展的体制机制改革，积极实施基于城市群的空间开发战略，建立城市群产业发展规划协调机制，提高城市群要素统筹配置以及跨区公共产品供给水平，推进城市群产业协同发展的体制机制创新，进一步提高粤港澳大湾区城市群功能分工水平。