斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析

来源 :中国实验动物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：feboy

【摘要】

：

目的了解斑马鱼核纤层蛋白（lamins）的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.

【作者】

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张衡璐黄惠敏叶芝旭王志华何志旭舒莉萍

【机构】

：

贵州医科大学附属医院儿科学教研室,贵州医科大学组织工程与干细胞实验中心,贵州医科大学免疫学教研室,贵州医科大学动物实验中心

【出处】

：

中国实验动物学报

【发表日期】

：

2016年4期

【关键词】

：

斑马鱼核纤层蛋白 lmna基因进化树共线性分析 Zebrafish Lamins lmna gene Phylogeny analysis Synteny

【基金项目】

：

国家自然科学基金（编号：31260284）

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目的了解斑马鱼核纤层蛋白（lamins）的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比,最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息,进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高,推断lmna、lmnb1和lmnb2

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