高通量测序分析不同浓度的白鲜碱对须癣毛癣菌转录组的影响

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[背景]目前,由皮肤浅部真菌引起的皮肤病逐年增加,已经成为影响人类健康的重大问题之一.[目的]探究白鲜碱(dictamnine,DIC)单体对须癣毛癣菌的抑菌作用及作用机制.[方法]通过高通量测序技术对须癣毛癣菌及白鲜碱作用后的须癣毛癣菌进行转录组测序,对测序序列进行处理和生物信息学分析,以及测序质量评价和序列注释.通过与对照组比较,鉴别出差异表达基因,然后进行GO功能显著性分析和KEGG代谢途径分析等.[结果]白鲜碱对须癣毛癣菌的MIC值为50 μg/mL.DIC高剂量组与对照组比较,共360个差异基因;其中上调表达265个,下调表达95个.MFS1、KU70、KU80、L2、paT、MFS2、VdtG、patC等基因表达有显著差异.GO功能富集表明,差异基因主要集中于核糖体、线粒体膜、抗氧化活性、毒素代谢过程、单一生物代谢过程、次生代谢过程、初级活性跨膜转运蛋白活性和活跃的跨膜转运蛋白活性等.KEGG代谢途径的改变主要集中在ABC转运、膜运输障碍、谷胱甘肽代谢、DNA的复制与修复变化、减数分裂、氧化磷酸化和丙酮酸代谢障碍等富集通路上,并且相关基因均有显著性改变(P<0.05).[结论]白鲜碱对须癣毛癣菌的抑菌机制可能与影响须癣毛癣菌DNA复制表达、能量代谢、DNA修复、ABC转运等途径有关.
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[目的]探究广东本地及移民学龄儿童的饮食结构及肠道菌群分布的差异.[方法]以广东深圳为采样点,随机抽样选取48名广东本地儿童和34名移民儿童,进行膳食问卷调查和晨便采集.采用Mann-Whitney U test分析本地及移民儿童饮食因子摄入频率的差异,并使用Illumina Miseq高通量测序技术对儿童的肠道菌群进行测序分析.[结果]82例儿童的膳食模式大多以米饭为主食,搭配蔬菜、优质肉类以及水果.但本地儿童在复合碳水化合物、蔬菜、海产品方面有更高的摄入量(P<0.05),而移民儿童在水果、低脂牛奶、
[背景]蜜环菌属(Armillaria)是一类营腐生或寄生生活的药食两用型真菌,研究其功能基因表达具有重要意义.[目的]筛选并获得蜜环菌(Armillaria mellea)最稳定的内参基因.[方法]以蜜环菌(A.mellea) 541为研究对象,以马铃薯琼脂糖培养基培养的菌丝和菌索为对照组,以添加还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate,NADPH)氧化酶抑制剂氯化二亚苯基碘鎓(diphenyleneiodonium chlo
[背景]植物促生菌剂产品在农业生产上的应用越来越广泛,但人们对促生菌在基质栽培条件下对作物根系微生物群落影响的了解有限.[目的]明确在基质栽培条件下促生菌假单胞菌(Pseudomonas sp.) JP2-3和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) Z54对番茄生长和根系细菌群落的影响.[方法]通过蘸根和灌根处理,分别将2株促生菌接种到基质栽培的番茄上.通过对番茄苗期各生长指标调查,明确促生菌对番茄生长的影响.利用16S rRNA基因扩增子测序技术,分析接种促生菌对番茄根系细菌群落组成和结构的
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