番茄多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定及表达分析

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该研究通过生物信息学手段,从番茄基因组中鉴定出11个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为SlPAO1-11),分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ);基因结构分析、蛋白质二级结构预测、亚细胞定位预测结果均显示,SlPAOs基因家族具有明显的亚家族分类特征.序列和进化分析结果显示,亚家族Ⅰ和Ⅱ中的SlPAO1~8属于典型的PAO基因,而亚家族Ⅲ中的SlPAO9-11编码蛋白还含有特异性的SWIRM结构域,SlPAO9-11属于组蛋白赖氨酸特异性脱甲基化酶,而非真正的PAO.选
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