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骨髓间充质干细胞因其具有强大的增殖能力、多向分化潜能及向损伤组织器官归巢的特点，使得各国学者都试着将其作为“种子细胞”，用于修复损伤的器官组织。在这些“种子细胞”的同种异体甚至异种移植过程中，人们不可避免地考虑到移植排斥问题。但大量资料显示，骨髓间充质干细胞具有独特的免疫学特性，其不表达组织相容性复合物Ⅱ类分子，可阻断树突状细胞的成熟，降低T细胞的免疫应答，并可通过分泌一些可溶性因子来介导免疫抑制。骨髓间充质干细胞这种独特的低免疫原特性使其在人和动物体内可以避免异种移植排斥反应的发生，更加显示出在移植治疗