自新课程改革以来，《分子与细胞》（人教版）深受广大教师和学生的喜爱，在教材内容的设计上，都体现出以教师为主导，学生为主体。然而笔者在教学过程中，发现学生对一些问题有很多不解，这些问题同样也让很多老师感到迷惑。但在教学中，大多数老师都是让学生死记硬背，根本不知道所以然。因此，笔者通过阅读大量文献以及自身在研究生期间的实验优势，对以下问题做一些分析。
　　1、核糖体、内质网与蛋白质合成之间的关系
　　《分子与细胞》（人教版）中关于核糖体、内质网的功能是这样叙述的：核糖体的功能是蛋白质合成的场所；内质网是由膜连接而成的网状结构，是细胞内蛋白质合成和加工，以及脂质合成的“车间”。对于这个问题在翟中和《细胞生物学》（第三版）[1]中明确指出细胞中的蛋白质都是在核糖体上合成的，并且都是起始于细胞质基质之中。蛋白质的合成是粗面内质网的主要功能。在粗面内质网上，多肽链一边延伸一边穿过内质网膜进入内质网腔中，以这类方式合成的蛋白质主要有：
　　（1）向细胞外分泌的蛋白质，即分泌蛋白。这类蛋白质常以分泌泡的形式通过细胞的胞吐作用输送到细胞外，这种蛋白质运输的方式易于分泌过程的调控。
　　（2）膜的整合蛋白。这类蛋白都具有方向性，其方向性在内质网上合成时就已确定。
　　（3）可溶性驻留蛋白。这类蛋白在合成后进入内质网，便于与其他细胞组分进一步区分，也有利于对它们的加工和活化。
　　由此看来，粗面内质网的主要功能是进行膜结合核糖体合成的蛋白质的运输，因此蛋白质的合成的起始场所都应该是核糖体，所以核糖体才是蛋白质的合成场所。
　　2、健那绿（Janus　Green　B）染线粒体的机理问题
　　《分子与细胞》（人教版）实验“用高倍镜观察叶绿体和线粒体”中，用健那绿（Janus　Green　B）对线粒体染色，使线粒体呈现蓝色，而细胞质接近无色。但对于健那绿染色（Janus　Green　B）机理以及染液是通过什么方式进入线粒体中，争论不断。笔者通过阅读资料后认为，健那绿（Janus　Green　B）通过线粒体的方式是自由扩散，原因有两个方面：
　　一、健那绿（Janus　Green　B）為吩嗪结构类染料，具有脂溶性，可以通过线粒体膜。
　　二、线粒体外膜含有孔蛋白，当孔蛋白打开时，可以允许5000道尔顿的分子通过，在实验中用的健那绿（Janus　Green　B）是1/5000，所以可以自由通过线粒体[2]。
　　线粒体中细胞色素氧化酶作为电子传递体和递氢体，周围有大量的H [1]，使染料保持氧化状态呈蓝绿色，从而使线粒体显色，而在周围的细胞质中染料则被还原，成为无色状态。
　　三、关于线粒体有氧呼吸释放能量问题
　　关于线粒体有氧呼吸释放能量问题，现行人教版高中教材，仍然认为1mol葡萄糖有氧呼吸共释放38个ATP，笔者认为不妥之处。
　　根据王镜岩《生物化学》第三版[3]，葡萄糖彻底氧化分解的过程如下：
　　葡萄糖在分解代谢过程中产生的能量有两种形式：直接产生ATP；生成高能分子NADH或FADH2，后者在线粒体呼吸链氧化并产生ATP。
　　（1）糖酵解：1分子葡萄糖生成2分子丙酮酸，共消耗了2个ATP，产生了4个ATP，实际上净生成了2个ATP，同时产生2个NADH。
　　（2）有氧分解（丙酮酸生成乙酰CoA及三羧酸循环）产生ATP、NADH和FADH2
　　丙酮酸氧化脱羧：丙酮酸生成乙酰CoA，生成1个NADH
　　三羧酸循环：乙酰CoA生成CO2和H2O，产生一个GTP（即ATP）、3个NADH和1个FADH2
　　那么葡萄糖分解代谢总反应式：
　　C6H6O6 6H2O 10NAD 2FAD 4ADP 4Pi（6CO2 10NADH 10H 2FADH2 4ATP
　　按照一个NADH能够产生2.5个ATP，1个FADH2能够产生1.5个ATP计算，1分子葡萄糖在分解代谢过程中共产生30个ATP：
　　2ATP （10×2.5）ATP （2×1.5）ATP=30ATP
　　参考文献
　　[1]翟中和，王喜忠，丁明孝.细胞生物学[M].北京：高等教育出版社，2008，178.
　　[2]王金发.细胞生物学[M].北京：科学出版社，2004，266.
　　[3]王镜岩，朱圣庚，徐长法.生物化学（下册）[M].北京：高等教育出版社，2004，65-142.