宫颈癌中免疫相关基因功能鉴定及ceRNA网络的构建

来源 :武汉大学学报(医学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lzjsja
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目的:利用生物信息分析技术,寻找宫颈癌中参与调节免疫反应的竞争性内源RNA(ceRNA)调节通路,及鉴定宫颈癌免疫相关基因和信号通路。方法:从GEO数据库和ImmPort数据库分别获取宫颈癌基因表达芯片数据、宫颈癌miRNA表达芯片数据和免疫相关基因群,通过软件预测相关的miRNAs和lncRNAs,并构建ceRNAs网络。将筛选所得的免疫相关基因和miRNA,进行宫颈癌临床样本中的表达分析,同时进行不同病理分期各候选基因表达分析、总体生存期和无病生存期分析。结果:鉴定2个参与宫颈癌组织中的免疫调控作用ceRNA调控通路:CCDC18-AS1—miR-106b-3p—CXCR4和HCG18—miR-193b-3p—TLR2。在宫颈癌组织中,lncRNA CCDC18-AS1对应的CCDC18的表达显著高于对照组织,而lncRNA HCG18的表达显著低于对照组织(P<0.05);CXCL8和IL18基因的表达显著高于对照组织;而癌组织中TLR2/4的表达显著低于对照组织(P<0.05)。对宫颈癌不同病理分期组织分析发现,早期癌组织中CXCR4的表达高于进展期(P<0.05),而CXCR2的表达趋势则是在晚期癌组织中显著高于早期阶段(P<0.01)。对宫颈癌患者的生存率分析中发现,CXCL8高表达的宫颈癌组总体生存期显著低于低表达组(P<0.05);而高表达TLR2宫颈癌组的无病生存期显著高于低表达组(P<0.05)。miR-193b的高表达组总体生存期显著低于低表达患者组(P<0.05);CCDC18与CXCR4的表达存在相关性(P<0.05)。结论:lncRNAs可能作为关键的ceRNA,通过调控miRNA和相关靶基因,介导了的宫颈癌病毒感染微环境及机体免疫反应之间的相互作用。
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