垂体瘤转化基因1在胃腺癌组织中的表达及其与患者预后的关系

来源 :中华肿瘤杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xutao6310794
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:鉴定胃腺癌新的预后标志物和治疗靶点。方法:通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载GSE33335和GSE63089基因表达数据集,共含有70例胃腺癌组织和配对的胃正常组织基因芯片数据,使用R语言分析胃癌组织和胃正常组织间差异表达基因。通过String在线分析工具构建差异表达基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。使用Cytoscape软件和分子复合物检测(MCODE)插件分离出关键基因集。使用在线数据库鉴定分离出与预后相关的关键基因,分别用数据库信息和南通大学附属医院2019年7—9月收治的32例胃腺癌组织和癌旁正常组织从mRNA和蛋白水平进行验证。结果:使用R语言分析显示,2个数据集中有128个共同差异表达基因,其中85个基因在胃腺癌组织中表达上调,43个基因在胃腺癌组织中表达下调。通过String在线工具和Cytoscape软件建立了PPI网络和MCODE模型,获得27个关键基因,其中有25个基因与胃腺癌患者的预后有关(n P<0.05)。25个与预后相关的基因中,有14个基因在胃腺癌组织中表达显著,其中有3个基因[垂体瘤转化基因1(PTTG1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和polo样激酶1(PLK1)]在细胞周期途径中显著富集。PTTG1在胃腺癌和胃正常组织中的阳性表达率分别为68.8%(22/32)和18.8%(6/32),差异有统计学意义(n P1.2 andn FDR<0.01) and 43 down-regulated genes (n log2FC<-1.2 andn FDR<0.01) in the GC tissues. PPI network model and MCODE model were established by using the Online String tool and Cytoscape software, and 27 key genes were obtained, including 25 genes related with prognosis of GC patients (n P<0.05). We identified 14 significant DEGs in GC tissues, including cyclin B1 (CCNB1), polo-like kinase 1 (PLK1) and pituitary-tumor transforming gene (PTTG1), which were significantly enriched in the cell cycle pathway through KEGG pathway enrichment analysis. The positive expression rate of PTTG1 in GC tissues was 68.8% (22/32), significantly higher than 18.8% (6/32) in normal gastric tissues (n P<0.05).n Conclusions:The expression of PTTG1 is different in GC and gastric tissues, implicates it is the key gene in gastric carcinogenesis. The prognoses of GC patients with higher PTTG1 expression are worse. PTTG1 might participate in the development of gastric adenocarcinoma by regulating cell cycle.
其他文献
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
为了掌握平棚栽培葡萄的适宜叶面积指数(LAI),在不加温的玫瑰露品种园内,试验比较了背荫叶片与向阳叶片的光合产物的生产能力。结果表明,背荫叶小区的干物质重量增加得较少:
内容摘要:课堂,作为学生和教师栖居的主要场所,应充满浓郁的诗意。语文课堂上,通过教师引导学生在体验中感受诗意情境,在对话中收获诗意感悟,在想象中创造诗意生活,在想象中创造诗意生活,让我们的语文课堂诗意盎然,勃发生命的活力。  关键词:体验 对话 想象 创作 诗意表达  诗人荷尔德林说:“人,诗意地栖居在大地上。”课堂,作为学生和教师栖居的主要场所,也应充满浓郁的诗意——流动着诗的灵性,洋溢着诗的浪
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
托尔斯泰历经十余年创作完成的史诗巨著《战争与和平》是其对自己审美原则的完美叙述和详尽总结。小说细致地描写了人们的心理在外界影响下的嬗变过程,敏锐地捕捉人的下意识,
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
真实的大自然,唯美、不造作的拍摄方式,女人天生对花的钟爱,是这套照片热卖的因素。在寻常花海中如何拍出新意?需把握好以下三点:1.风格的确定:根据花的种类及色彩策划主题。
<正> 中国社会科学院中国边疆史地研究中心第一届学术委员会第四次会议于1990年10月27日下午举行。“边疆中心”主任、学术委员会主任吕一燃同志主持了会议,“边疆中心”副主任马大正同志向委员们汇报了“边疆中心”的近期工作。一年来,“边疆中心”以稳中求进为指导方针,在做好各项常规工作的基础上,重点抓了下述工作:①《近代中国边界沿革史》(进行中的“七五”重点项目);