利用生物信息技术预测RhD蛋白质抗原活性表位

来源 :中国输血杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dzf2006
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目的预测人RhD蛋白刺激B淋巴细胞产生相应抗体的抗原活性表位。方法利用生物信息技术及互联网平台,以TMHMM和TMpred预测蛋白跨膜区结构为基础,通过ABCpred和BepiPred方案初步筛选RhD蛋白抗原活性表位,并以Swiss-Model Workspace同源模建的RhD蛋白三级结构作抗原表位定位。结果预测人RhD蛋白的N端36~41、100~104、353~356区段为RhD抗原活性表位区域。结论上述结果可作为确定结果 RhD蛋白潜在优势表位的参考。 Objective To predict the human RhD protein-stimulated B lymphocytes to produce the corresponding antigen-active epitopes. Methods Based on the prediction of TMHMM and TMpred protein transmembrane domains using bioinformatics and Internet platforms, the RhD protein antigenic epitopes were screened by ABCpred and BepiPred protocols and the RhD protein tris Level structure for epitope mapping. Results The N-terminal 36 ~ 41,100 ~ 104,353 ~ 356 segments of human RhD protein were predicted to be RhD antigen active epitope region. Conclusion The above results can be used as a reference for determining potential RhD epitopes.
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