基于MassARRAY平台的人血小板抗原基因分型的质谱检测方法

来源 :南京医科大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:cwzhq
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目的:建立基于MassARRAY质谱iPLEX分析技术的人血小板抗原(human platelet antigen,HPA)基因分型方法.方法:通过文献检索HPA1-29W系统的单核苷酸多态性突变或缺失位点的信息,确定35个目的基因突变位点,按MassARRAY突变位点标示方法、引物设计固定格式和引物设计软件在线设计90条引物(正、反向扩增引物和延伸引物各30条),以12个插入HPA1-29W野生型和突变型序列的合成质粒以及50例已知HPA分型的献血者样本进行扩增和质谱检测,分析灵敏度、特异度和重复性,随机抽取15例样本的一代测序和质谱分型结果进行对比验证,建立检测方法.结果:基于MassARRAY平台的HPA基因分型的质谱检测方法与测序法检测结果相符合,灵敏度为100%,特异度为100%,重复性为100%.结论:成功建立基于MassARRAY平台的HPA1-29W系统的质谱分型方法,适合中国人群HPA分型,具有临床应用前景.
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