【摘 要】
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bHLH基因家族作为植物中数量最多转录因子家族之一，参与和调控植物生长发育。为探究尼泊尔黄堇bHLH基因家族成员特性，本研究采集野生尼泊尔黄堇全株进行全长转录组测序，筛选鉴定到81个尼泊尔黄堇bHLH基因家族成员，利用生物信息学方法对61个bHLH基因家族成员的理化性质、保守结构域及基序、顺式作用元件、三级结构和蛋白互作进行了分析，并将尼泊尔黄堇和模式植物拟南芥bHLH蛋白进行系统进化分析。结果表
【基金项目】
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青海省科学技术厅基础研究项目（2022-ZJ-714）资助；
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bHLH基因家族作为植物中数量最多转录因子家族之一，参与和调控植物生长发育。为探究尼泊尔黄堇bHLH基因家族成员特性，本研究采集野生尼泊尔黄堇全株进行全长转录组测序，筛选鉴定到81个尼泊尔黄堇bHLH基因家族成员，利用生物信息学方法对61个bHLH基因家族成员的理化性质、保守结构域及基序、顺式作用元件、三级结构和蛋白互作进行了分析，并将尼泊尔黄堇和模式植物拟南芥bHLH蛋白进行系统进化分析。结果表明：对初筛得到的81个尼泊尔黄堇bHLH家族成员进行BLAST比对和SMART结构域预测，最终确定具有bHLH保守结构域的序列有61个，其编码蛋白均具有亲水性；蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主，亚细胞定位预测显示主要分布在细胞核，尼泊尔黄堇bHLH基因家族蛋白具有共同的保守结构域bHLH，且数量变化范围为1～7个；该基因家族含有多种与逆境胁迫和植物激素相关的顺式作用元件，其中光响应元件为主要元件。系统进化树分析表明，尼泊尔黄堇bHLH基因家族总体可划分成10个亚家族（I～X亚家族），且在X亚家族中包含bHLH成员数量最多，Ⅶ亚家族中bHLH成员数量最少。本研究为进一步研究尼泊尔黄堇bHLH基因家族在其响应逆境胁迫中的作用提供一定的参考。
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