甘蔗花叶病毒复制酶基因的克隆及序列分析

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以甘蔗花叶病毒(SCMV)福建分离物(FJ)的总RNA为模板,用RT—PCR方法扩增了含有复制酶(NIb)基因的DNA片段,将其克隆到质粒pGM—T载体上并进行了序列分析。结果表明,NIb基因由1563个碱基组成,编码521个氨基酸并含有高度保守序列GDD。NIa/NIb和NIb/CP交界处的蛋白酶切割位点分别为Q/C和Q/A。与国外报道的SCMV亚组几个株系分离物相比,NIb基因(福建分离物)的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为57.8%~86.9%和60.9%~95.2%,其中与SCMV—SA株系的核苷酸
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