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结合前期穗粒数主效QTL-qKnps-4A定位结果及靶区段分子标记探针信息,通过3个巢式RIL群体4个环境穗粒数表型数据和188个‘科农9204’与‘京411’衍生的重组自交系群体(KJ-RIL) 10个环境穗粒数表型数据进行了qKnps-4A物理定位分析,将其分别定位于Xwmc 730-wPt-8091(物理位置:4A:664209916-4A:736770981)与Ax-1 11729029-Ax-112286181(物理位置:4A:671926767-4A:684269262)物理区间.结合穗粒数主效稳定QTL紧密连锁标记(LOD峰值下标记)Ax-108966946基因型值,对188个KJ-RIL家系进行分组和产量性状表型数据方差分析,解析了来自京411的qKnps-4A优异等位基因对产量性状影响;结果表明qKnps-4A优异等位基因能够显著增加穗粒数及单株产量,对于粒重、单株穗数有一定的负向效应,平均单株产量增加6.06％.利用310份育成品种(系)在qKnps-4A靶区段基因型值,系统分析了靶区段优异单倍型的育种应用情况.结果 表明,qKnps-4A优异单倍型已经被育种家选择,但还有较大的遗传改良空间.研究结果对穗粒数主效QTL-qKnps-4A遗传改良及分子育种应用提供理论参考.