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郑单958是我国目前推广面积最大的玉米单交种，具有高产稳产、多抗、耐密、杂种优势强等突出的优点。通过亲本郑58和昌7-2的表型特征、系谱来源、基因组的遗传结构分析，对郑单958的遗传结构及杂种优势的机理进行了初步研究。结果表明：郑58和昌7-2在的60个不同SSR位点上存在着60％的差异，其中在基因内的SSR位点上有70．6％的差异，远远高于基因组SSR位点上的差异（55.8％）。两亲本功能基因的遗传变异可能是郑单958杂种优势强的主要原因之一。