基于RNA-seq技术的杂交鳢生长相关基因SNP位点搜索

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本文基于RNA-Seq技术对杂交鳢同家系子代的肝脏进行了转录组测序,获得相关转录组信息并进行生长相关基因SNP位点搜索。试验结果表明,由于杂交鳢的GH基因与数据库中的物种的同源性较差,GH基因并未从NCBI的核酸库中比对到,仅比对到其他2个生长相关基因(IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ)。其中,IGF-Ⅱ基因上检测到存在SNP位点,25:GA;50:CA;318:GT。IGF-Ⅰ基因上未发现SNP位点。
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