结合我军防疫工作实际，着重论述了近年来部队卫生防疫工作取得的进展和面临的挑战与对策。近年来，部队卫生防疫工作取得了明显成绩：（１）卫生防疫保障能力明显增强；（２）卫生防疫工作网络化格局逐步形成；（３）规范了有关卫生防疫工作条令条例；（４）卫生防疫经费逐步落实：（５）卫生防疫人才培养得到加强；（６）部队发病率得到控制。部队卫生防疫工作面临的挑战：（１）传染病仍然严重地威胁着部队健康；（２）不良生活方式对部队健康的影响日益突出；（３）非传染性疾病对部队健康的危害值得警惕；（４）新时期军队战略方针对卫生防疫工作提出了更高的要求。面向２１世纪部队卫生防疫工作对策：（１）要适应当代医学模式的转变；（２）要逐步理顺卫生防疫结构编制，加强卫生防疫保障能力；（３）要提高卫生防疫人员素质，加强专业人才的培养；（４）要加大卫生防疫经费投入，改善防疫技术装备；（５）要严格卫生法制管理，建立规范的监督管理机制；（６）要加大健康教育的力度，提高官兵的卫生素质。