【摘 要】
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目的运用生物信息学方法筛选出新的肝细胞癌(HCC)预后生物标志物。方法通过GEO2R筛选GSE14520数据集中的差异表达基因(DEG),利用STRING构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape软件筛选出关键基因。DAVID进行GO和KEGG分析,然后使用GEPIA分析关键基因在HCC中的表达以及与预后的关系。结果GSE14520数据集共筛选出348个差异表达基因,其中91个上调基因,257个下调基因。从PPI中筛选出排列最前的2个网络模块:模块1和模块2。两个模块中位于网络中心区域的关键基因共46
【机 构】
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桂林医学院生物技术学院生物化学教研室
【基金项目】
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国家自然科学基金地区科学基金项目(31660317),广西自然科学基金青年科学基金项目(2018JJB140233)。
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目的运用生物信息学方法筛选出新的肝细胞癌(HCC)预后生物标志物。方法通过GEO2R筛选GSE14520数据集中的差异表达基因(DEG),利用STRING构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape软件筛选出关键基因。DAVID进行GO和KEGG分析,然后使用GEPIA分析关键基因在HCC中的表达以及与预后的关系。结果GSE14520数据集共筛选出348个差异表达基因,其中91个上调基因,257个下调基因。从PPI中筛选出排列最前的2个网络模块:模块1和模块2。两个模块中位于网络中心区域的关键基因共46
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