采用Illumina MiSeq高通量扩增子测序技术，对巴氏杀菌乳在10、15、25 ℃贮藏温度下细菌多样性进行分析。研究贮藏过程中巴氏杀菌乳中细菌群落结构演替，并比较不同贮藏温度下巴氏杀菌乳中细菌的群落组成及相关预测功能的差异。结果表明：3个温度条件下巴氏杀菌乳在贮藏前期，多样性指数基本恒定，可培养的菌落总数维持在2～3 lg CFU/mL之间，此阶段优势菌属为不动杆菌属（Acinetobacter）和肠杆菌属（Enterococcus）；随着贮藏时间的延长，细菌多样性下降，25 ℃贮存的下降最快，10 ℃最慢，芽胞杆菌属（Bacillus）逐渐成为优势菌属，与此同时，菌落总数也在快速增加。Tax4Fun法分析代谢功能图谱发现在细胞新陈代谢、遗传信息加工和环境信息处理等丰度较高，且在贮藏过程中均有不同程度的变化。各项结果表明，巴氏杀菌乳在温度失控条件下贮存货架期快速缩短，芽胞杆菌属可能是导致腐败的主要原因。该研究可为巴氏杀菌乳贮藏过程中细菌群落变化研究及品质控制提供参考。