目的明确中药金汁的菌群结构和数量,阐明金汁和粪菌移植液的菌群差异。方法课题组在福建省泉州市花桥慈济宫采集了金汁样本9份,在宁夏标准粪菌移植库制备粪菌移植液9份。采用宏基因组学16S rRNA技术对9份金汁和9份粪菌移植液样本的菌群进行检测。结果金汁和粪菌移植液在门、纲、目、科、属和种等不同生物学等级进行对照研究,发现丰富度差异较大的10个菌属,金汁中的变形菌从门、纲、目、属和种等不同层级的丰富度均高于粪菌移植液(t=2.647 1,P=0.003 2)。金汁中的厚壁菌门、拟杆菌门、梭杆菌门和放线菌门的丰富度明显低于粪菌移植液(t=2.824 9、2.782 1、3.684 5、2.735 4,均P<0.01,)。结论中医金汁的菌群生物学特征明显不同于现代的粪菌移植液。