汉坦病毒M基因区核苷酸序列及G1膜蛋白部分氨基酸共享序列分析

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目的 对青岛地区31株汉坦病毒分离株M区基因序列测定及基因分型研究,为疫苗接种提供依据.方法从64例肾综合征出血热(HFRS)患者发热期血清标本中提取RNA,应用套式逆转录聚合酶链反应扩增汉坦病毒基因组M片段,G1基因区克隆并测定核苷酸序列和部分共享氨基酸序列,且对测定结果应用DNA Star和Prosis软件进行分析.结果 64份标本中测出汉滩型(HTN)6份,占9%;汉城型(SEO)25份,占39%;总阳性率48%.SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,其基因的离散度为0.3%~8.9%.HTN型汉坦病毒变异率较高,基因的离散度为2.6%~11.2%.结论 SEO型汉坦病毒基因型相对保守,而HTN型变异率较高;M区段可编码一个具有稳定的保守抗原表位。

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