汉坦病毒A9株M基因片段核苷酸序列的测定及分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fanrend
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采用反转录-PCR方法,分节段扩增汉坦病毒A9株M基因片段cDNA,并克隆入pGEMT载体中,用双脱氧末端终止法直接测定序列。结果表明,A9株M片段cDNA由3618个碱基组成,编码1135个氨基酸,  核苷酸序列及由其推导的氨基酸序列同76/118株的同源性分别为94.33%和97.80%,说明汉坦病毒A9株与76/118株在糖蛋白的结构上高度保守。同76/118株比较,在3’末端非编码区变异极大,变异率为20%,且多了2个核苷酸。A9株M基因片段核苷酸序列的获得,为利用该cDNA进行基因工程疫苗的研制创造了条件。 The reverse transcriptase - polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the cDNA of M gene of Hantavirus strain A9 by segmented amplification and cloned into pGEMT vector. The sequence was directly determined by dideoxy terminator method. The results showed that the M segment cDNA of A9 strain consisted of 3618 bases and encoded 1135 amino acids. The homology of the deduced amino acid sequence with that of 76/118 was 94.33% and 97.80 %, Indicating that the Hantavirus strains A9 and 76/118 are highly conserved in glycoprotein structure. Compared with the 76/118 strain, there is a great variation in the 3’-end non-coding region with a mutation rate of 20% and more than two nucleotides. A9 strain M gene fragment nucleotide sequence obtained for the use of the cDNA genetically engineered vaccine to create the conditions.
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