【摘 要】
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目的寻找肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性的预后相关微小RNAs(micro RNAs,miRNAs),为LUAD患者预后预测及个性化治疗方案制定提供依据。方法下载TCGA数据库中522例LUA
【机 构】
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南京医科大学附属南京医院检验科,南京医科大学附属南京医院中心实验室
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目的寻找肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性的预后相关微小RNAs(micro RNAs,miRNAs),为LUAD患者预后预测及个性化治疗方案制定提供依据。方法下载TCGA数据库中522例LUAD患者组织标本的miRNA-Seq数据和临床病理及生存时间数据,用R语言对LUAD与癌旁组织中差异miRNAs进行分析。采用LASSO&COX回归模型在训练集(245例LUAD)中进行LUAD预后相关miRNAs筛选,并构建基于7个miRNAs表达谱的线性风险模型。根据风险值的高低,以中位风险值为界将患者分为高、低风险组,并分别在测试集(245例LUAD)和总体标本(490例LUAD)中对风险模型预测患者预后的有效性进行验证。采用COX回归分析miRNAs风险模型是否是独立的预后因子。结果 LUAD组织与癌旁组织中共有72个差异表达的miRNAs(上调45个、下调27个)。从训练集中确定miR-101-3p、miR-148a-3p、miR-192-5p、miR-193b-3p、miR-505-3p、miR-584-5p和miR-99a-5p7个与总生存期相关的miRNAs构建预后风险模型。在训练集、测试集及总体标本中,高风险组患者与低风险组患者相比,总体生存时间均显著降低(P均<0.05)。经多因素COX回归分析,风险模型在训练集、测试集及总体样本中均是一个独立的预后因子(训练集HR=1.97,P=0.02;测试集HR=1.927,P=0.009;总体HR=1.909,P=0.001)。结论研究确定了7个与LUAD患者预后相关的miRNAs,基于7个miRNAs构建的风险模型是1个独立的预后因子。
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