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从城市生态系统功能的概念、现状出发，介绍了转基因生物对提高生物品质和生物多样性，改良城市土壤。促进城市绿化，促进城市景观发展，降低工业生产成本与工业污染，节约水资源，净化水体，提供能源，促进医学发展等生态系统服务功能的影响；同时对转基因生物扩散过程中可能出现的超级杂草或超级害树。外源毒蛋白对非目标生物毒的毒害，加快目标害虫种群的进化速度，产生新病毒。威胁人体健康。影响生物地球化学循环与城市生态安全等负面效应进行了分析。