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结合实验室运行和管理的实际情况，详细分析了高校MEMS(Micro-Electro-Mechanical S5fstem)实验室的特点和管理中遇到的难点，包括：环境要求高、实验人员专业背景多样、人室人员数量日益增多、存在多种危险源等。针对管理中的难点，探索了较实用且有效的管理方法。提出了基于5S理念的现场管理方法；并建立相应的人员培训与考核机制；构建网络化的数据库管理机制。经过多年管理实践和不断改进，得到较好的管理效果，不仅保证了实验室高效运行，而且有效控制了安全事故的发生率。