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基于RAD—seq简化基因组测序技术获得椭圆叶花锚（Halenia ellipitica D．Don）简化基因组水平上的序列信息并开发SSR分子标记。利用SRsearch软件检测而得到双端各有至少100bp的五种类型的SSR（二、二三、四、五、六核苷酸）位点共6201个，并成功设计其中3865个SSR引物。在能成功设计引物的SSR位点中，置核昔酸SSR位点最多；重复序列长度包括17种（12～36bp）；重复序列的基序共达316种，其中五核苷酸基序种类最多（91种）。从中挑选65对可对应五种SSR类型的引物