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目的 应用生物信息学方法分析激素受体阳性乳腺癌基因芯片数据,筛选内分泌治疗(ET)耐药组与敏感组间差异表达基因(DEGs),探索内分泌治疗耐药可能相关的信号通路。方法 在基因表达汇编(GEO)数据库选取GSE67916、GSE51390基因芯片数据,利用GEO2R分析芯片集ET耐药和敏感组间的DEGs,利用Venn diagram筛选两个芯片集中共同表达的DEGs。通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建DEGs对应蛋白间的互作网络(PPI),筛选出前20个关键蛋白,应用DAVID数据库对20个关键蛋白对应基因进行GO分析及KEGG分析。应用Kaplan-Meier plotter数据库对20个关键基因进行预后分析,选取本中心乳腺癌ET敏感和耐药患者的病理标本,采用免疫组织化学法(IHC)检查关键DEGs基因相应蛋白的表达,验证蛋白表达情况与ET耐药的关系。结果 从两个芯片集中筛选出共同表达DEGs 184个,其中上调基因68个、下调基因116个。以构建PPI网络分析获得的关联性最强的前20个基因为本研究的主要对象。使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析20个基因与激素受体阳性乳腺癌无复发生存(Recurrence-free survival, RFS)的关系,结果显示11个基因的表达与乳腺癌RFS相关(P均<0.05),分别是PTPN11、SDC1、CD24、ITPR1、GATA3、PLCG2、ESR1、PGR、ERBB4、TP53及FGFR2。本中心数据库中按1∶1随机选取ET耐药和敏感病例及对应病理标本(21对),IHC检测20个蛋白,结果显示,ERBB4、PTPN11、GATA3、TP53、PGR、PLCG2、SDC1等7个DRGs在激素受体阳性的乳腺癌组织中显著高表达。结论 SDC1等7个免疫相关基因可能成为预测激素受体阳性乳腺癌患者发生内分泌治疗耐药的生物标志物,为临床诊疗提供新策略。