基于生物信息学技术筛选并分析激素受体阳性乳腺癌内分泌治疗耐药相关基因

来源 :遵义医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:basilmhb
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 应用生物信息学方法分析激素受体阳性乳腺癌基因芯片数据,筛选内分泌治疗(ET)耐药组与敏感组间差异表达基因(DEGs),探索内分泌治疗耐药可能相关的信号通路。方法 在基因表达汇编(GEO)数据库选取GSE67916、GSE51390基因芯片数据,利用GEO2R分析芯片集ET耐药和敏感组间的DEGs,利用Venn diagram筛选两个芯片集中共同表达的DEGs。通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建DEGs对应蛋白间的互作网络(PPI),筛选出前20个关键蛋白,应用DAVID数据库对20个关键蛋白对应基因进行GO分析及KEGG分析。应用Kaplan-Meier plotter数据库对20个关键基因进行预后分析,选取本中心乳腺癌ET敏感和耐药患者的病理标本,采用免疫组织化学法(IHC)检查关键DEGs基因相应蛋白的表达,验证蛋白表达情况与ET耐药的关系。结果 从两个芯片集中筛选出共同表达DEGs 184个,其中上调基因68个、下调基因116个。以构建PPI网络分析获得的关联性最强的前20个基因为本研究的主要对象。使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析20个基因与激素受体阳性乳腺癌无复发生存(Recurrence-free survival, RFS)的关系,结果显示11个基因的表达与乳腺癌RFS相关(P均<0.05),分别是PTPN11、SDC1、CD24、ITPR1、GATA3、PLCG2、ESR1、PGR、ERBB4、TP53及FGFR2。本中心数据库中按1∶1随机选取ET耐药和敏感病例及对应病理标本(21对),IHC检测20个蛋白,结果显示,ERBB4、PTPN11、GATA3、TP53、PGR、PLCG2、SDC1等7个DRGs在激素受体阳性的乳腺癌组织中显著高表达。结论 SDC1等7个免疫相关基因可能成为预测激素受体阳性乳腺癌患者发生内分泌治疗耐药的生物标志物,为临床诊疗提供新策略。
其他文献
目的 探讨无痛胃镜检查中全程护理管理对患者情绪、复查依从性的影响。方法 选取2018年11月至2020年10月行无痛胃镜检查患者110例,随机分成对照组和观察组,每组55例。对照组采用常规检查护理,观察组实施全程护理管理,评价2组患者情绪、并发症、护理满意度及复查依从性。结果 观察组焦虑自评量表(SAS)、抑郁自评量表(SDS)低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。观察组护理满意度、复查依
弹簧摆是高中物理常见的组合模型.从一个弹簧摆的错题出发,首先用实验证实其错误的原因,其次应用牛顿力学和分析力学推导出运动方程,最后应用MATLAB数值仿真得出正确答案.
名著导读是统编本初中语文教材的重要内容,也是语文教育界研究和实践的难点问题。基于中国知网学位论文的综述发现,当前对名著导读的研究包括课程、教材、教学三个层面的内容,但课程层面的研究非常薄弱,教材层面的研究缺乏学理性,教学层面的研究未能切中要害。将名著导读的课程编制作为研究重点,教师作为研究主体,以课例研究为主要研究方法,可望有所突破。
鉴于无碳小车轨迹的复杂程度,以往的转向机构广泛应用的曲柄滑块机构和空间连杆机构已不适用于复杂多变的轨迹应用。本文提出一种新型凸轮转向机构的设计方案,对凸轮的参数设计进行了详细计算;给出无碳小车“S”和“8”字轨迹传动系统的计算;为小车的可调性设计了一种简易、实用性强的新型微调转向机构;同时鉴于小车对精度的过度依赖,陈述了无碳小车设计建造及运行时的注意事项及其他细节设计与操作。
“碳中和电影”是以碳中和为表现与传播对象的电影,以碳中和作为元素影响剧情发展,反映环境变化,关注碳排放导致的气候变暖,同时关注通过碳中和行为来抵消碳排放,展示碳中和的影响。从生态电影视域,可探究碳中和电影的三个阶段演进过程。第一阶段为高碳电影,反映人与自然环境的高度冲突;第二阶段为低碳电影,反映人类寻求一种人与自然的和谐共处的方式,从而采取绿色、低碳行为;第三阶段为碳中和电影,其唤醒或引导大众关注
本文介绍了将GeoGebra用于具体教学环节若干案例,为培育学生的核心素养地具体实施提供了素材.
复方短效口服避孕药(COC)是全球女性常用的避孕用药,也是临床异常子宫出血的紧急止血与长期管理用药之一。虽然COC中合成的雌孕激素对静脉血栓或急性心肌梗塞、脑卒中等动脉血栓形成有一定的负面影响,但随着新型COC中雌激素含量的减少及孕激素结构的改变,单纯COC致血栓形成事件已相对少见,总体临床获益远优于其弊端。对于有遗传血栓倾向或合并高龄、高血压、糖尿病、吸烟、免疫性疾病、血管结构异常等获得性血栓高
目的 探讨家庭一体化产房(LDR)模式下新生儿早期基本保健项目母婴肌肤接触对产妇产后抑郁、焦虑及创伤后应激障碍的影响。方法 选取2019年9月—2020年8月在杭州市妇产科医院自然分娩的产妇120例为研究对象,按病区(普通产科病区和LDR病区)分为对照组和观察组,每组各60例。对照组产妇在普通产房顺产分娩后采用传统母婴接触30 min,观察组产妇在LDR产房顺产分娩后采取新生儿早期基本保健项目进行
目的:分析江苏省精神卫生资源配置现状。方法:运用Lorenz曲线、Gini系数和泰尔指数分析来研究江苏省精神卫生资源配置的公平性。结果:截至2020年底,江苏省每10万人口精神科实际开放床位为32.16张,精神科执业(助理)医师、从事精神卫生工作的护士数分别为2.83名和7.07名。按人口分布计算上述三类资源的Gini系数分别为0.10、0.15、0.13,按地理面积分布计算上述三类资源的Gini
当前,我国已经全面完成脱贫攻坚,实现了第一个百年奋斗目标,步入实现第二个百年奋斗目标的新征程。党的十九大提出推进乡村振兴战略,并提出了二十字总要求,在这些要求中,乡风文明作为乡村振兴之“魂”,意义重大。本文以平凉市崆峒区为例,探讨在推进乡村振兴过程中,该地区乡风文明的推进和建设情况,找出存在的问题,并提出对策建议,以期探索如何运用乡风文明助推乡村振兴战略在崆峒大地落地生根。