随着我国全面深化改革的持续推进，社会的多样性和风险性显著增高，应急管理主体成长和传统应急管理模式之间的张力日益凸显；有效整合社会资源，更好发挥社会组织在应急管理中的独特功能与优势，成为提高公共危机治理效能的必然选择。在现实层面，新冠肺炎疫情防控是当前社会组织参与应急管理实践的一个重要方面，可以作为检验社会组织参与应急管理效果的试金石。通过建构包含能力嵌入、关系嵌入和制度嵌入三个维度的综合性嵌入式治理分析框架，对公益慈善组织参与新冠肺炎疫情防控的有效性进行考察，可以发现，社会组织在参与应急管理方面存在信任缺失、协同不足、功能错位等问题，制约着社会组织在应急管理中功能的有效发挥。为提高社会组织参与应急管理的有效性，应以社会组织能力建设实现信任重塑；以社会网络关系优化实现组织协同；以外部制度环境优化实现社会组织公共性重构。