高等植物中SOD基因的基因流特性与亲缘关系分析

来源 :怀化学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tangbao1006
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以20种高等植物SOD基因编码区序列(CDS)为参考,进行基因流特性与亲缘关系分析.通过下载20个物种SOD基因的完整CDS序列,并分析其单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性、平均核苷酸差异数目及单一多态位点和简约多态位点等信息,建立系统进化树;分析其氨基酸结构域并预测跨膜结构域;再分析SOD基因所编码蛋白质的氨基酸数量、组成及部分理化性质.研究结果表明:SOD基因在种内及种间遗传分化较明显.由系统进化树可知,各物种种间的遗传进化关系与植物分类学中的分类基本一致.结构域预测得大部分序列具有一个保守的结构域
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