广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列变异分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mengyidaocaoren
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目的

了解广州市男男性行为HIV-1主要流行株Gp120基因的序列特征。

方法

收集广州市男男性行为HIV-1感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录巢式PCR扩增获得HIV-1膜基因Gp120全长,对获得的序列进行系统进化树、长度多态性、V3环氨基酸、辅助受体预测及特征性氨基酸分析。

结果

61例样本分为4个亚型,主要流行株为CRF07_BC(34/61,55.74%)和CRF01_AE亚型(24/61,39.34%)。主要流行株Gp120序列长度为496~515个氨基酸,V1和V3高变区分别表现出最高和最低的长度多态性。主要流行株V3环顶端四肽的主要形式为GPGQ(56/58,96.55%),4种方法综合预测主要流行株的辅助受体主要为CCR5(50/58,86.21%)。广州市男男性行为HIV-1感染者中流行的CRF01_AE亚型毒株存在4个特征性氨基酸,出现频率为0.75~0.83,CRF07_BC亚型毒株存在8个特征性氨基酸,出现频率为0.74~0.94。

结论

广州市男男性行为HIV-1感染者主要流行株Gp120序列长度有着较高的多态性,V3环顶端四肽、辅助受体和特征性氨基酸有其自身特点。

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