十年前英国《自然》杂志刊出62页的长文《人类基因组初步序列和分析》，标志着人类基因定序计划的初步成就，近年《自然》杂志为此一专文发表的十周年，特别刊出社论和20多页分析专文，展现出对人类基因定序计划的一种乐观信念，其社论标题《最好的还没来》，也呼应了当期《自然》杂志封面上的大标题：《未来是光明的》。近代生命科学对于人类生命现象的探索，之所以会走向一个以基因为单元的化约之路，有一个漫长的历史过程。基本上，这不是一种自然直观的思维，因为在人类早期的经验里，面对复杂庞大的生命现象，总是将之视为一个整体。
　　近代生命医学上承的文艺复兴那个传统，可以说对近代生命医学的化约思维有着决定性的影响。文艺复兴人体解剖学兴起，使生命整体存在的观念有了改变，解剖学一方面大大丰富了人类对身体内在组织结构的了解，同时也影响人类对生命体的概念。一个活体的生命，其实可以是一些固执无变动器官的组合物，人体的组织器官，无一不可以分离探究，就如同一个机械体的组成组件，一种新的整体生命的化约观念，也就渐渐深入人心，一直延续至今。
　　文艺复兴之后在欧洲萌起的近代科学，承袭着同样的一个化约思想，自然宇宙中的物质一如生命现象，莫不可以用化约方式来探索；于是先有化约思维在物质探索中的灿然大成，17世纪以后的近代科学，也逐步在以微观视野的物资探索知识，成就其文化强势地位；掌握微观，便控制了巨观，也掌控了物质的现象。生命科学的化约思维来得较晚，19世纪门德尔虽已提出遗传分离原则，但是终其一生，他的想法并没有受到青睐，到他死后16年，经19世纪末所谓“三人同时再发现门德尔遗传原则”的科学历程，到20世纪才得到世人肯定。
　　有了门德尔遗传分离原则化约思维的开路，20世纪再有接续工作，由摩根的果蝇染色体到艾佛利肺炎双球菌、德布吕克的噬菌体研究，最后才有了1953年华生和克里克的解构遗传核酸DNA双螺旋结构的大成就。这一连串的发展，可以说是给当前以基因化约审视生命的主流思维，奠下了坚实的根基。
　　18世纪以降，物质科学由化学元素的化约，到19世纪末原子结构的探索，以至20世纪粒子物理的化约发展，可以说迭有佳构，也造成深远的影响。物质科学化约论的成功，不仅在思想上给生命科学带来理论倚恃，物质科学化约发展成就的精进微观技术，也使得生命科学的化约作为成为可行。
　　生命科学的基因化约发展，虽有掌握微观细节的优势，但是面对复杂庞巨的生命现象，仍有见树难见林的困蹙，旁的不说，1999年几例动见观瞻的基因治疗大挫败，便可一叶知秋。另外美国麻省理工学院凯乐2007年在《自然》杂志的《二种文化冲突》专文，亦点出以物质科学思维，来追寻一个生命科学普适理论的基本哲学困境。
　　人类基因定序初稿发表十年来，虽有基因治疗的挫败，疾病治疗的突破亦甚有限，但是对于基因内里信息的累聚，以及个别基因与遗传瑕疵或疾病关联性的建立，并非没有成绩，尽管生命医学面对社会渴求研究讯息快速转译出治疗作为的压力，但整体的支持还是正面的。
　　无论如何，基因信息的大量累积和甄别比对技术的快速进展，不论会不会带来真正的突破，在当前科研体系机制之下，生医研究的基因化约之路，只会一路向前。但是这个文艺复兴以降的近代医学传统，面对着生命现象的复杂庞巨，内里因果关系的非线性对应，以基因单元探究生命现象，已然不是一个纯粹客观的技术问题，更牵涉到对于疾病的概念，以及对于生命价值的一种主观抉择和认定。