以中医临床治疗乳腺增生的首选中成药小金丸为例,对比生物活性检定与化学指纹图谱在小金丸整体质量评价中的适宜性与科学性。测定小金丸抗血小板聚集生物效价与环氧化酶2 （cyclooxygenase-2, COX-2）抑制率,建立小金丸脂溶性和水溶性双部位指纹图谱,对A、B 2个厂家16个批次市售小金丸进行指纹图谱分析,对比研究小金丸在生物活性和化学分析层面的一致性。本研究动物实验方案已获成都中医药大学附属医院实验动物伦理学委员会批准（批准号:2018BL-002）。结果表明, 16个批次小金丸的抗血小板聚集生物效价在0.712～1.278 U·mg-1,相对标准偏差（RSD）为15.4%; COX-2抑制率在52.07%～68.95%, RSD为8.91%,结果显示生物效应差异较小,生物活性一致性较好。16个批次小金丸指纹图谱相似度差,近一半样品相似度小于0.9,共有峰峰面积在各样品中RSD达32.74%～165.37%,化学一致性差。为探究小金丸生物活性一致性好而化学一致性差的原因,对指纹图谱色谱进行多元统计分析,筛选影响相似度的主要色谱峰,并进行色谱峰药材归属指认。结果显示各批次小金丸的相似度主要受脂溶性指纹图谱中面积较大的17、18、20、23、27号色谱峰,水溶性部分30号峰的影响,经鉴定这些色谱峰属于枫香脂和当归。进一步研究不同浓度枫香脂、当归抗血小板聚集与抑制COX-2活性的作用,结果表明在小金丸组方比例下,枫香脂、当归几乎没有抗血小板聚集和抑制COX-2活性的作用。本研究发现化学指纹图谱用于小金丸质量一致性评价存在一定的局限性,部分丰度高、光谱响应强、活性弱的色谱峰成为影响评价结果的主要因素,选择反映临床功效的生物评价方法能很好弥补化学评价方法的不足,为复杂中成药的整体质量评价提供新思路与方法。