人巨细胞病毒包膜糖蛋白B线性B细胞抗原表位的预测

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目的通过生物信息学方法分析人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)包膜糖蛋白B(glycoprotein B,g B)的结构及理化特性,预测g B的线性B细胞抗原表位。方法基于HCMV g B的序列,利用两种在线B细胞表位预测程序及DNAstar软件对g B进行预测;利用SWISS-MODEL服务器同源构建g B三级结构模型,进行进一步验证。结果与结论综合多项分析,预测得到HCMVg B的多个线性B细胞表位,为后续验证其优势中和表位,建立富含高效价中和抗体的原料血浆的筛选方法奠定了基础。 OBJECTIVE: To analyze the structure and physicochemical properties of glycoprotein B (g B) in human cytomegalovirus (HCMV) by bioinformatics methods and to predict the linear B cell epitope of g B. Methods Based on the sequence of HCMV g B, two on-line B cell epitope prediction programs and DNAstar software were used to predict g B. The g B tertiary structure model was homologously constructed by SWISS-MODEL server for further validation. RESULTS AND CONCLUSIONS A number of linear B-cell epitopes of HCMVg B were predicted by comprehensive analysis of multiple assays, which laid the foundation for the screening of the dominant neutralizing epitope of HCMVg B and the establishment of a screening method for plasma containing high titer neutralizing antibody.
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