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本研究旨在利用计算机方法对水稻胚乳特异性表达基因进行挖掘和功能分析，及特异性顺式调控元件的预测。我们将基因在不同组织中的表达信号谱看作多维空间内的向量，利用向量夹角余弦法计算其与理想状态下该基因在某一组织特异表达向量的相似度，以此来判断组织特异性表达基因。本文通过对水稻芯片数据的大规模分析，共挖掘出了127个在水稻胚乳中特异表达基因。并对其启动子进行顺式元件预测，发现两个与胚乳特异表达相关的顺式调控元件，其保守序列分别为CATGCATSCM和GATCGATCGR。与已知功能的顺式元件比较显示，前者为种子特