整合多组学数据探究灵芝抗衰老作用

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衰老是生命发展的必然进程,随年龄增长,其机体整体功能下降。灵芝属于“药食同源”,据《神农本草经》记载,具有扶正固本、延年益寿的功效。灵芝含有多种活性成分,包括灵芝多糖类、三萜类、核苷类和蛋白质等,还含有锰、铁、锌和硒等多种微量元素;具有显著的免疫调节、抗肿瘤和降血糖等多种药理作用。灵芝是否延缓机体衰老,一直存在争议。因此,本论文采用灵芝干预自然衰老的C57BL/6J雄性小鼠,拟从行为学、甲基化组学、肠道菌群、转录组学等方面系统研究灵芝抗衰老的作用和机制。本论文主要得到了以下结果:(1)灵芝干预可以改善小鼠的衰老表型,如改善驼背现象、改善毛发密度和亮度。长期的灵芝干预显著降低小鼠的体重。(2)采用三个甲基化位点Prima1、Hsf4和Kcns1估算小鼠甲基化年龄。结果提示灵芝干预会影响甲基化年龄,干预20周时灵芝干预组的甲基化年龄略低于对照组,可能存在潜在的影响。(3)采用16S r DNA测序,探究灵芝干预对肠道菌群的影响。采用灵芝喂食自然衰老小鼠,可以显著改变实验组和对照组之间的β多样性,影响肠道菌株的丰度和多样性,菌群相关性发生改变并有所降低。对菌群丰度进行分析,发现益生菌的丰度增加;条件致病菌的丰度降低。(4)采用转录组测序,探究中药灵芝干预对基因表达的影响。RNAseq结果表明,与心脏功能相关的衰老基因Angpt1与Atp6v1h显著下调,RT-q PCR验证结果一致。(5)行为学实验结果表明灵芝干预对小鼠的运动能力、自主行为和探究行为无显著作用。综上,本论文使用甲基化测序、16S r DNA测序、转录组测序以及行为学实验多角度评估了长期灵芝干预对自然衰老小鼠的影响。结果提示长期灵芝干预可以通过改变肠道菌群的构成与丰度,以及影响心脏炎症相关的基因表达进而影响小鼠的衰老进程。
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