政府作为为公民和社会提供优质高效服务的公共组织，不断提高运作效率、优化行政绩效、提高服务质量成为其主要目标之一。在《中华人民共和国公务员法》、《公务员考核规定（试行）》颁布实施之后，公务员的考核工作也越来越引起社会各界的重视。海关作为负责国家进出境管理的行政机关，具有垂直领导、队伍庞大、专业性和独立性强的特点。目前虽然已有面向全体公务员的“德、能、勤、绩、廉”的综合考核方针，但海关系统不同层级机构（海关总署、直属海关、基层海关）的公务员由于工作任务、性质、管理方法、业务特点等各方面的差异，统一的考核要求不能完全适用。本文把公务员考核现有体系与绩效考核理论做阐述与融合，将人力资源有关理论引入基层海关公务员管理中，探索人力资源有关理论、方法应用于政府公务员管理的途径和方法。通过借鉴国内外公务员绩效考核经验、企业绩效考核方法，以A海关为例从基层入手，构建基层海关公务员绩效考核指标体系，重新梳理考核流程，重视考核结果应用，最终设计符合基层海关实际的绩效考核体系，提出改进措施，对于提高基层海关运转效率、提升基层海关公务员形象具有一定的现实指导意义。