目的:　　SLIT2基因位于人染色体的4p15.2，编码了人类与果蝇SLIT同源的一个分泌性糖蛋白，其主要功能是在中枢神经系统发育过程中指导轴突形成的方向和神经细胞的迁移，SLIT2为抑癌基因并在乳腺癌及卵巢癌中均发现SLIT2甲基化现象。本研究以肝细胞癌病人的癌及癌旁组织作为研究对象。通过全长引物PCR及DNA测序来研究SLIT2基因启动子区在肝细胞癌中的甲基化特点及各CG位点的甲基化频率及规律，揭示其与肝细胞癌的发生发展及临床病理学特征的关系。　　方法:　　肝细胞癌手术切除病人40例，男32例，女8例;年龄23-82岁，中位年龄56岁。其中合并肝硬化27例，HBV阳性28例，HCV阳性5例。按WHO标准进行病理分级，低分化8例、中分化19例、高分化13例。所有病例均为单发肿瘤（肿瘤直径1.5-12cm），术前均未进行过放化疗。各病理组织标本取自肝细胞癌灶和癌旁肝组织。DNA提取后，通过亚硫酸氢钠处理DNA，用全长引物PCR及DNA测序的方法检测SLIT2基因启动子碱基序列，从而明确CG位点甲基化的变化特征及其与临床病理学特征的相关性。本实验为组织DNA甲基化测序而非细胞系，组织标本DNA无法达到完全甲基化或非甲基化，DNA甲基化读取结果多有杂带，用单纯的阴性及阳性结果会导致统计结果误差。本实验结果采用计分制对DNA测序结果甲基化程度进行判定，即以同次测序的重叠位点T与C位点峰值高度作为评分标准，总分为5分。　　结果:　　评分法统计结果，40例肝癌组织中评分3分及3分以上位点比例占39.6％，而40例癌旁组织中仅占18.8％;高分化肝癌组织13例中3分及3分以上位点比例占35.69％，中分化肝癌组织19例中占40.42％，低分化肝癌组织8例中占43.5％，各病理分级与甲基化程度差异均具有显著性(P＜0.05)。SLIT2基因的甲基化分值与性别，年龄，肝硬化，TNM分期，有无包膜无明显相关性(P＞0.05)。而AFP高低分组（界值400ng/ml）及有无HBV感染组间SLIT2基因的甲基化分值有显著差异(P＜0.05)。对肝癌组织中SLIT2基因CG位点中各位点甲基化频率进行比较，SLIT2基因启动子序列中自起始位点上游-570bp至-550bp段中的3个CG位点中3分及3分以上者所占比率分别为75％、72.5％及72.5％，显著高于其他CG位点(P＜0.05)。　　结论:　　研究表明，SLIT2基因甲基化与肝细胞癌的预后有关且SLIT2基因的甲基化可能与肝细胞癌发生发展有关，是一个早期现象。SLIT2基因可成为肝细胞癌的一个新的肿瘤标记因子与其他肿瘤因子联合用以肝细胞癌的筛查及预后均具有重要诊断价值，为肝细胞癌的靶向药物治疗提供新的方向对靶向药物的因子及靶点选择具有重要意义。