党的第十八届五中全会指出创新是引领发展的第一动力,必须摆在国家发展全局的核心位置,并且大会还将创新驱动确立为加快科学技术发展促进中国现代化建设的国家战略。为了平稳有效地推进创新型国家建设,通过增强集群创新能力促进我国关键核心技术与产品质量的全面提升是一种重要的途径。从我国集群发展现状可以发现,虽然我国产业集群的数量庞大,但与国外发达国家相比,总体创新能力还有待提高,正面临着从传统低成本为优势的集群向创新型集群转型升级的挑战。即使是一些发展态势良好的创新型集群,仍然存在协同创新性不足、关键技术短板明显、创新效率较低、创新扩散缓慢等问题。因此,在集群创新网络环境中,如何提升创新企业的创新效率,促进整个集群协同创新发展,是我国集群创新网络治理亟需解决的实际问题。本文针对集群创新网络的协同治理展开了深入研究。现有集群创新网络相关研究主要集中在企业创新行为和网络结构特征,从网络拓扑结构和企业创新行为相结合的视角对集群创新网络协同治理研究还十分缺乏。为弥补集群创新网络现有研究缺失,本文利用多智能体模型,对集群创新网络进行建模分析企业创新行为和网络拓扑结构的相互作用,探讨了集群创新网络的协同治理策略。具体包含以下3个问题:（1）影响集群协同创新效果的关键因素有哪些?（2）不同发展阶段集群应该如何治理以实现其内部企业之间的协同创新?（3）针对集群不同的创新信息传输效率,集群创新网络应该采用怎样的治理策略来实现协同创新?为研究以上问题,本论文首先对集群创新网络、网络治理理论、协同创新理论和多智能体模型进行了文献梳理和评述,发现现有研究存在的缺失;然后以成熟期和成长期的创新型集群为样本,采用深入访谈并运用扎根理论方法,提炼出影响集群协同创新绩效的关键因素,从而为后续模型构建和仿真研究奠定了理论基础;随后根据所得出的关键因素以及集群不同阶段特性,来分别构建了相应的多智能体模型,以便对集群协同创新治理问题展开深入研究。为更好地描述集群企业的创新行为,论文建立了依赖于创新知识积累的企业创新行为动力学模型。在此基础上,论文首先从网络结构稳定性角度,区别了成熟期和成长期两个不同阶段集群,成熟期集群具有稳定的网络结构,而成长期集群的网络结构不稳定;然后在每个阶段,又根据创新信息的传输效率,考虑了信息传输即时和信息传输延迟不同情形,分别构建了相应的多智能体模型,进行了相关的理论分析和仿真模拟,并针对集群发展的不同阶段,不同信息交流效率,提出了相应的基于事件触发的集群创新网络协同治理策略。论文运用多智能体模型对集群创新网络协同治理进行了研究,其主要结论包括:（1）利用扎根理论研究方法对收集的原始资料素材进行编码分析,获得了影响集群协同创新的5个关键因素,即信息传输效率、网络拓扑结构、企业间创新势差、企业阶段性创新势差和政府管理方式。（2）基于集群企业创新特性,建立了依赖于创新知识积累的企业创新行为动力学模型,构建了成熟期集群创新网络领导—跟随者多智能体模型,设计了基于事件触发的集群创新网络协同治理策略。研究表明,创新知识积累程度与协同创新程度呈倒U型关系;领导企业激励强度与实现协同创新效率呈正相关性;网络治理强度与协同创新程度呈正相关性;无标度网络结构更有利于实现成熟期集群协同创新,随机网络结构不利于实现成熟期集群协同创新。（3）从信息传输效率的视角,设计了包含网络拓扑结构、企业创新势差、信息传输时滞等因素的集群创新网络协同治理策略,探究了具有信息传输时滞的成熟期集群创新网络的协同创新。研究表明,固定治理周期与协同治理频率呈负相关性;信息传输时滞与协同创新程度呈负相关性;网络治理强度与协同创新程度呈倒U型关系;在具有信息传输时滞的情况下,无标度网络仍然是最利于实现成熟期集群协同创新的网络结构类型。（4）创新性地引入T-S模糊方法处理了成长期集群创新网络拓扑结构的不稳定性,并建立了T-S模糊集群创新网络多智能体模型,设计了T-S模糊集群创新网络协同治理策略。研究表明,创新知识积累程度与协同治理频率呈负相关性;固定治理周期与协同治理频率呈负相关性;网络治理强度与协同创新程度呈正相关性;从集群网络结构角度分析,由随机网络结构向小世界网络结构演变的成长期集群更有利于实现协同创新;从集群网络规模的角度分析,网络规模的增加并不会影响所设计的协同治理策略实现集群协同创新。（5）考虑了创新信息扩散的延迟性对成长期集群协同创新的影响,建立了具有信息传输时滞的网络切换多智能体模型,设计了基于非周期采样的协同治理策略。研究表明,信息传输时滞与协同创新程度呈负相关性;网络治理强度与协同创新程度呈正相关性;随着网络规模和网络结构类型的变化,不会影响集群创新网络协同治理策略的有效性;具有小世界网络特性的成长期集群网络最有利于实现协同创新,具有随机网络特性的成长期集群网络不利于实现协同创新。