【摘 要】
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蛋白质是生物体关键的组成成分,存在于细胞中不同区域的蛋白质它们的功能也不一样。所以,预测蛋白质在细胞中的位置能更好的了解它们的功能。我们建立了一个新的单定位凋亡蛋
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蛋白质是生物体关键的组成成分,存在于细胞中不同区域的蛋白质它们的功能也不一样。所以,预测蛋白质在细胞中的位置能更好的了解它们的功能。我们建立了一个新的单定位凋亡蛋白质数据集,通过特征筛选提取了氨基酸n肽组分信息、蛋白质骨架信息、化学位移信息和蛋白质保守位点的进化信息,并根据蛋白质物理化学特性提取了亲疏水信息,最后将以上各单特征信息进行融合,采用支持向量机(SVM)算法及加权K近邻(K-Nearest Neighbors, KNN)算法对单定位细胞凋亡蛋白质数据集进行分类预测,Jackknife检验下总体预测成功率分别达到了81%和77.9%。以单定位凋亡蛋白质数据集为标准集,本文还构建了一个多定位凋亡蛋白质数据集作为独立测试集,以氨基酸二肽组分信息和蛋白质骨架信息作为多定位凋亡蛋白质数据集的特征参数。结合加权K近邻(K-Nearest Neighbors, KNN)算法对其进行预测,总体预测成功率达到60.9%。
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