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多花黑麦草(Lolium multiflorum Lam.),隶属于禾本科(Poaceae)黑麦草属(Lolium),具备牧草的多种优良品质,也称一年生黑麦草、多花黑麦草。本研究利用43个SSR标记探究来自世界不同国家和地区的33份多花黑麦草的263个单株的遗传多样性和群体结构,并与10个重要农艺性状(株高,分蘖数、单株鲜重、单株干重等)进行关联分析,以期达到加速多花黑麦草育种进程、有效缩短育种年限的目的,以更加精准、快速的方式育成优良的品种。主要结果如下:(1)调查263份多花黑麦草种质资源的10个重要农艺性状,利用SPSS软件对田间数据进行分析和处理。结果表明:10个性状的变异范围在13.93%~48.98%之间,平均变异系数为26.06%。其中单株干和鲜重的变异系数最大,有利于进行高产种质的筛选。农艺性状的相关性分析表明:影响多花黑麦草产量的10个农艺性状之间并不是孤立的,而是相互关联的。(2)从218对引物中筛选出43对扩增稳定、条带清晰、多态性高SSR引物。SSR结果显示:90.7%的SSR位点属于高度多态性信息引物,可以很好地反映供试材料的遗传多样性;33个多花黑麦草群体的平均观测杂合度水平(Ho=0.605)高于平均预期杂合度(He=0.573),平均固定指数(Fis)小于0,整体呈现杂合子过剩的现象。AMOVA结果显示:33个多花黑麦草群体的遗传变异主要是由群体内的差异引起的(群体内占69%,群体间占31%)。(3)STRUCTURE聚类分析将263个单株聚成4个亚群(P1,P2,P3和P4)。系统发育树(NJ树)将所有供试材料划分成5个亚群(G1、G2、G3、G4、G5)。除了STRUCTURE中P2亚群里的三个种质(C13、C22和C25)在NJ聚类分析中被划在新亚群G5中之外,其余聚类结果均一样。聚类结果显示:每个亚群中包含来自不同国家和地区的种质,而来自同一国家和地区的种质可以聚类到不同的亚群,这一结果表明263个多花黑麦草的群体结构与地理分布不完全相关,呈现无规律的现象。(4)利用混合线性模型(MLM)对43个SSR标记和10个农艺性状进行关联分析,共得到17个关联位点,其解释了6.2%(LMgSSR03-04F对PH)?18.6%(LMgSSR10-12F对PH)的表型变异。有4个SSR位点与株高相关联;各有2个SSR位点与分蘖数、倒二叶长、穗长、节数、单株鲜重相关联;有1个SSR位点与倒二叶宽、小穗数、单株干重相关联。本研究为缩短多花黑麦草的育种进程提供了潜力,为分子标记辅助育种奠定了理论基础。