【摘 要】
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目的:1.探讨肿瘤cGAS/STING信号传导中的四个关键分子(MB21D1、TMEM173、TANK结合激酶1(TBK1)和IFN调节因子3(IRF3))在癌组织中的表达情况及其基因的甲基化水平。2.探讨在部分肿瘤类型中,cGAS/STING信号与免疫细胞的浸润的关系。3.探讨高表达cGAS/STING与某些恶性肿瘤患者的预后关系,为抗癌免疫的临床应用提供依据。方法:从TCGA,MethHC和c
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目的:1.探讨肿瘤cGAS/STING信号传导中的四个关键分子(MB21D1、TMEM173、TANK结合激酶1(TBK1)和IFN调节因子3(IRF3))在癌组织中的表达情况及其基因的甲基化水平。2.探讨在部分肿瘤类型中,cGAS/STING信号与免疫细胞的浸润的关系。3.探讨高表达cGAS/STING与某些恶性肿瘤患者的预后关系,为抗癌免疫的临床应用提供依据。方法:从TCGA,MethHC和cBioPortal数据库获取肿瘤mRNA RNA-Seq-HTSeq片段每千碱基外显子模型每百万映射读数、甲基化水平数据,并分析甲基化与不同靶基因的表达的相关性。分析cGAS/STING信号转导中免疫细胞浸润和关键分子表达的相关性以及cGAS/STING通路与CTLA-4阻滞临床疗效的相关性。使用基因表达谱分析交互式分析评估MB21D1、TMEM173、TBK1和IRF3mRNA表达对预后的影响。结果:1.基于MB21D1、TMEM173、TBK1和IRF3的表达,肿瘤中cGAS/STING信号普遍上调。2.不同类型的恶性肿瘤中MB21D1、TMEM173、TBK1和IRF3的启动子甲基化水平不同。3.在癌症患者中MB21D1、TMEM173、TBK1和IRF3基因存在较高的体细胞突变率。4.肿瘤微环境中MB21D1、TMEM173、TBK1或IRF3基因表达与免疫细胞浸润有关。5.MB21D1、TMEM173、TBK1和IRF3基因的表达影响癌症患者预后。结论:1.cGAS/STING信号在多数癌组织中高表达,同时在部分癌组织中低表达或无明显差异。2.在某些肿瘤类型中,高度上调的cGAS/STING信号与免疫细胞的浸润呈负相关。3.cGAS/STING信号通路一些基因的表达水平可以预测一些癌症患者的预后。
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