高分子链塌缩及流场驱动高分子链迁移穿过微通道过程的耗散粒子动力学模拟

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外界条件的变化会导致稀溶液中高分子链的性质及动态行为发生一系列变化。近年来,这一领域一直受到广泛关注。研究这些现象有助于我们理解诸如蛋白质折叠,生物大分子穿过生物膜上的微通道进入细胞内等重要的生命活动过程的机理。此外,这些现象在生物工程,工业生产中亦有广泛应用。例如,理解了蛋白质折叠的机理有助于诊断一系列由于蛋白质错误折叠而导致的病症;可以通过电场驱动使单链DNA穿过微孔道进行测序等。本文采用耗散粒子动力学方法,分别研究了高分子链塌缩的动态行为,及高分子链在流场的驱动下穿过管径比自身均方末端距小的细通道的动态行为。首先,我们研究了高分子链的塌缩过程。在从良溶剂到不良溶剂的淬火过程中,高分子链会经历“无规线团-塌缩小球”这一转变过程。随着研究的深入,人们逐渐认识到流体力学相互作用和溶剂导致的多体效应在这一过程中不可忽视。这两种效应影响了高分子链的塌缩路径及所需时间。耗散粒子动力学方法是采用显性溶剂粒子的介观模拟方法。与其他方法相比,该方法的粒子间相互作用很自然地包含了上述两种效应。通过模拟,我们发现塌缩过程大致可分为5个步骤:局部聚集,局部增大,整体聚集,生成松散的塌缩球,进一步松弛成排列紧密的塌缩球。我们研究了不同链长的高分子在不同淬火程度下的塌缩过程,发现这一过程的动态路径遵循“珍珠项链”模型,并不会陷入“香肠”状亚稳态中。我们还统计了各阶段所需的时间与塌缩程度和链长的标度关系。最后,我们得到了塌缩的总时间τc与淬火程度ζ和链长N的标度关系为τc~ζ-0.46N0.98接着,我们研究了在流场驱动下,高分子链迁移穿过微通道的过程。高分子链在足够大的流场的作用下沿着流场方向被逐渐拉伸,从而能够穿过管径小于其自身尺寸的微通道。通过耗散粒子动力学模拟,我们发现这一过程经历了:(1)靠近微通道管口;(2)进入微通道入口并克服势垒;(3)成功穿过微通道三个步骤。模拟结果证实了,高分子链穿过微通道的临界流量与高分子链长无关;且高分子链通过微通道的概率与流量变化的曲线是光滑的,这说明高分子链从完全被阻挡到完全可以通过并不是一个突变的过程。同时,我们的模拟结果还统计了高分子链穿过微通道所需的时间τ与链长N,流量J和高分子链刚性1/λP的关系。结果发现,当高分子链较长时,τ与链长N呈线性关系,且随着流量增大而逐渐变短;而1/λp越大,刚性越强,τ越短。
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