大湄公河次区域间日疟原虫遗传多样性和群体遗传学研究

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背景:东南亚大湄公河次区域已制定到2030年彻底消除疟疾的目标。近年来该地区疟疾的发病率明显下降,但间日疟感染所占的比例明显增加,疟疾的传播主要集中于边境地区,输入性疟疾已经成为疟疾传播的主要来源。因此,深入了解间日疟原虫的传播动力学特征,比较实施疟疾控制措施前后间日疟原虫群体结构的变化,能够为制定针对性的疟疾控制策略提供理论依据。方法:应用10个微卫星分子标记对206个来自大湄公河次区域边境地区不同年份的间日疟原虫样本进行基因型分析,其中2004年中缅边境地区样本50例;2016年中缅边境地区样本52例;2012年泰国西部泰缅边境地区样本50例;2015年泰国西部泰缅边境地区样本54例,以评价中缅边境和泰缅边境地区间日疟原虫群体的遗传多样性和种群结构变化。结果:1.在强化的疟疾控制策略下,中缅边境和泰国西部泰缅边境地区间日疟原虫种群的遗传多样性水平仍然较高(HE=0.66-0.86)。中缅边境地区,2004年间日疟原虫种群的期望杂合度为0.76,2016年间日疟原虫种群的期望杂合度下降至0.66;而在泰缅边境地区,间日疟原虫种群的期望杂合度由2012年的0.80升高至2015年的0.86。4个间日疟原虫种群多克隆感染的比例差异显著(P<0.05),在中缅边境地区,2004年间日疟原虫种群的多克隆感染比例为48%,2016年间日疟原虫种群的多克隆感染比例下降至30.7%(P<0.05);在泰缅边境地区,2012年间日疟原虫种群的多克隆感染比例为40.0%,2015年间日疟原虫种群的多克隆感染比例下降至23.7%(P<0.05)。感染复数(MOI)同样呈现下降趋势。随着大湄公河次区域疟疾发病率的下降,间日疟原虫种群多位点连锁不平衡现象更加显著,表明间日疟原虫种群存在明显的空间聚类。2.中缅边境和泰国西部泰缅边境地区的4个间日疟原虫种群存在明显的遗传分化;在中缅边境和泰缅边境地区,不同年份的间日疟原虫种群间存在明显的遗传分化,在中缅边境地区,2004年间日疟原虫种群与2016年间日疟原虫种群间遗传分化系数(FST)为0.081;在泰缅边境地区,2012年间日疟原虫种群与2015年间日疟原虫种群间遗传分化系数为0.133。2004年中缅边境地区与2016年中缅边境地区以及2012年泰缅边境地区间日疟原虫种群间存在一定程度的聚类,表明这些间日疟原虫种群可能来源于共同的祖先。2015年泰缅边境地区间日疟原虫种群与其他间日疟原虫种群遗传分化明显,表明可能存在种群替换。2004年中缅边境地区间日疟原虫有效群体大小为4979,2016年中缅边境地区间日疟原虫有效群体大小下降为3052。泰缅边境地区间日疟原虫有效群体大小由6289升高至10259。3.本研究应用中缅边境、泰缅边境、中国安徽地区间日疟样本,创建了具有较高地理起源预测能力的微卫星面板,该微卫星面板应用较少数目的位点即可对间日疟原虫种群进行溯源检测,确定间日疟感染的地理起源,能够简便、快速实现对间日疟的流行病学监测,锁定感染源,为进一步制定针对性的控制策略提供理论依据和重要的基线信息。结论:大湄公河次区域实施强化的疟疾控制措施后,中缅边境和泰缅边境地区间日疟原虫种群存在明显的时间和空间遗传分化;但是间日疟原虫种群仍存在较高水平的遗传多样性。大湄公河次区域中缅边境和泰缅边境地区间日疟原虫种群的群体遗传学研究为该地区间日疟原虫的流行病学监测提供了理论依据。加强对中缅边境和泰缅边境地区间日疟原虫种群的流行病学监测,进而制定针对性的疟疾控制策略,对实现消灭疟疾的目标具有重要意义。
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