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水体富营养化是一个众所周知的全球性环境问题。研究表明，发生富营养化的水体中的蓝藻死亡后会释放藻毒素，其中微囊藻毒素的出现频率最高、造成危害最严重。微生物降解是目前为止最为安全有效的一种去除微囊藻毒素的方法。本研究利用同位素示踪技术对微囊藻毒素进行标记，研究厌氧条件下微囊藻毒素的降解，并对降解微生物群落进行了多样性分析，对了解沉积物中MC的迁移转化规律、降低水体中藻毒素浓度和保障饮用水安全等都有很大意义。本研究对铜绿微囊藻的生长条件（如温度、光照条件及不同碳源）进行了优化，确定其最佳生长、产毒条件，并对铜绿微囊藻进行碳同位素标记培养，发现25°C、55μmol/(m2·s)为铜绿微囊藻的最佳培养条件；有机碳源比无机碳源更利于铜绿微囊藻的生长，但微囊藻毒素产量并不提高；有机碳源培养的铜绿微囊藻胞内及胞外可溶性蛋白含量高于无机碳源所培养的铜绿微囊藻所产生的可溶性蛋白含量；有机碳源培养的铜绿微囊藻中参与藻毒素合成反应的氨基酸的含量比无机碳源培养的铜绿微囊藻中的低；Na213CO3培养的铜绿微囊藻所产的碳同位素标记的铜绿微囊藻被标记于MC-LR的Glu位置上。芦苇厌氧降解复合菌群及池塘厌氧降解复合菌群用微囊藻毒素对其进行了驯化，MC-LR主要作为芦苇及池塘厌氧降解复合菌群生长的氮源，37°C是两种复合菌群的最佳生长温度。且池塘厌氧降解复合菌群的降解能力要比芦苇厌氧降解复合菌群的降解能力强。在MC-LR的厌氧降解过程中发现降解产物，包括苯乙酸、鸟氨酸及尿素等以及最终降解产物甲烷，推测MC-LR的厌氧降解途径为MC-LR先发生开环然后进一步被降解为苯乙酸、鸟氨酸、尿素等。同时本实验运用16S rRNA基因克隆文库的方法对芦苇及池塘厌氧降解MC-LR的复合菌群进行了微生物多样性分析，最终实验发现，螺旋体门、变形菌门、厚壁菌门及未培养的Candidate divisionWWE1在芦苇及池塘这两种厌氧降解复合菌群中都存在。池塘厌氧降解复合菌群细菌主要分为7个门，其中Candidate divisionWWE1，螺旋体门，脱铁杆菌门，变形菌门是最主要的门类；芦苇厌氧降解复合菌群细菌主要分为4个门，其中拟杆菌门，变形菌门，螺旋体门是主要优势门类。芦苇及池塘厌氧降解复合菌群中古菌都为广古菌门，为厌氧过程中产甲烷发挥主要作用。在池塘厌氧降解复合菌群细菌中CT-B-10可能为新的MC-LR厌氧降解菌株。