骨髓增生异常综合征患者的基因表达谱研究

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骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的克隆性疾病,表现为全血细胞减少、骨髓病态造血,患者高风险转化为急性白血病,被认为代表着白血病发生的前期过程。根据骨髓中原始细胞和铁粒幼细胞比例、外周血单核细胞数量,FAB协作组将MDS分为(1)难治性贫血(RA);(2)伴有铁粒幼细胞的难治性贫血(RAS);(3)原始细胞增多的难治性贫血(RAEB):(4)转化中的RAEB(RAEBt):(5)慢性粒单核细胞白血病(CMML)。迄今为止,形态学异常仍然是诊断MDS的重要标准。然而,由于各系细胞病态造血表现轻重不一,有些患者仅表现为单系异常如特发性大红细胞性贫血、单纯性中性粒细胞减少或血小板较少甚至没有明显病态造血现象,这些“早期MDS”或“not yet MDS”有时与巨幼细胞性贫血(MA)、缺铁性贫血(IDA)等增生性贫血和慢性再生障碍性贫血(CAA)难以鉴别。染色体异常为疾病的克隆性提供了诊断性依据,但其检出率仍不高。因此,了解MDS患者基因表达谱的改变不但能够深入理解MDS发生的分子基础,而且可能会为MDS的有效诊断提供可靠的分子标记。本研究通过应用高通量的微阵列技术研究MDS患者的基因表达谱,试图找到若干个与MDS发病或诊断相关的基因改变。 我们首先将2例经形态学确诊的早期阶段MDS患者(RA和RAS)的骨髓单个核细胞(BMNC)来源的等量总RNA标本混合后应用含13484个基因克隆的H141s芯片(上海博星基因芯片公司)进行重复cDNA芯片杂交,证实了微阵列技术在MDS研究应用中的可行性,但芯片实验的重复性并不非常理想,需要进行重复以去除芯片操作如逆转录、标记、杂交、洗涤、扫描等过程所引起的表达偏差;我们对上述2例患者的表达谱结果和上海博星公司研究的3例急性髓系白血病(2例AML-M2和1例AML-M5)患者的表达谱结果进行了生物信息学检索,从中挑选出在MDS或AML中表达异常并且可能与造血调控相关的500个功能已知基因,在上海博星公司定制了10张芯片,每张芯片上每个基因重复点样4次。我们应用该芯片进一步对10例MDS患者(4例RA、1例RTC、4例RAEB和1例RAEBt)的BMNCs进行了表达谱分析,结果发现在5例以上MDS患者中均有表达差异的基因共有95个,其中下调基因68个,生物信息学分析揭示40个基因累及细胞生长和分化调控、细胞周期调节、·昆髓增生异常综合征患者的基因表达谱研究中文摘要信号传导、氧化还原反应等过程,如血小板反应素一1(THBSI),磷酸酶和紧张素同源盒基因(PTEN),MAX二聚化蛋白(MAD),DNA损伤诱导的转录因子(DDIT3);_七调基因27个,其中19个参与细胞生长和分化调控、细胞周期调节、信号传导、氧化还原反应等过程,包括。ts变异基因1(ETVI)、G 1/5期转化因子(GSPTI)、叉头盒O3A(FOXO3A)、谷肤甘肚过氧化酶1(GPXI)、亚铁鳌合酶(FECH)等。此外,分化抗原CD36在4例患者中表达增高。我们对患者的基因表达谱进行了层次聚类分析,结果可将10例患者分为2组:1例RA患者、2例RAEB和1例RAEBT患者被聚在同一组;3例RA患者一、l例RrC患者和2例RAEB患者聚在一组。非常有意义的是,RTC患者的血液学表现与其他患者明显不同,聚类分析也将该患者与其他RA患者分在2个独立的亚组。应用半定量PCR对3个基因RNAHP、GSPTI和ETVI的分析证实了芯片中所揭示的表达趋势。 为了发现可能与MDS发病相关或对MDS具有诊断意义的候选基因,我们挑选了微阵列研究在多数患者中均有较大表达差异的5个靶基因:RNAHP、DDIT3、FOXO3A、GSPTI、ETVI,并应用半定量R手PCR进一步对它们在50例MDS(28例RA、巧例RAEB、7例RAEBt)、38例ANIL和17例正常对照中的转录本水平进行了检测。统计分析揭示RNAHP、GSPTI和DDIT3的半定量R工PCR结果与芯片相似,在MDS患者与正常对照之间的差异存在着高度显著性(P值分别<0.001,<0.05,<0 .001);而ETVI和FOX03A的相对表达水平在MDS患者和正常对照之间并无差异(P>005)。此外我们发现,MDS随着病情进展,RNAHP的表达水平逐渐增高,但RA与RAEB组比较差异并不显著(P>0.05),而RA、RAEB与RAEBt的差异都具有高度显著性(P值分别<0 .001和0.01);RAEBt与AML之间的差异无显著性(P>0.05)。DDIT3的结果与RNAHP相似,RA和RAEB两组之间并无差异,但两组与RAEBt比较,前者的差异接近于统计意义水平(P一0.053),后者的差异具有统计意义(P=0.046);同样,DDIT3在RAEBt和AML之间无明显差异。 虽然ETVI在MDS中与正常对照并无差异,但该基因在AML(Ml一5)中表达水平显著降低,而在AML(M6)中表达却明显上升,并且在红白血病细胞系K562中的表达水平与正常对照比较也增高,但在其他白血病细胞系如TFI、Raji、U937、NB4等表达却为阴性或极低。而GSPTI和FOXO3A在RA、RAEB、RAEBt和AML骨髓增生异常综合征患者的基因表达谱研究中文摘要中均无显著性差异。 由于部分早期MDS患者缺乏明显病态造血表现,有时与CAA和其他贫血难以鉴别。为此,我们进一步检测了巧例CAA、12例增生性贫血(IDA7例、MA3例、月卑机能亢进2例)患者并将之与RA患者进行了比较。统计表明RNAHP在RA和CAA、其他贫血患者之间的差异都具有显著性(尸<0 .05);ETVI在RA和CAA之间的差异也具有显著性(?
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