随着经济全球化的迅猛发展和国际竞争的加剧,跨国公司一改以往将R&D活动集中于公司母国的传统,纷纷在海外设立R&D机构,R&D活动国际化布局已经成为跨国公司全球化经营战略的一个重要组成部分。与此同时,随着中国市场在全球经济中地位的逐步提高,20世纪90年代以后,跨国公司在加大对华贸易和生产投资的同时,纷纷到中国设立R&D机构,特别是近四五年掀起了在华R&D投资的热潮。面对这一新现象,许多学者从不同的角度进行了分析,但主要集中在现状、特征、活动类型和这些R&D机构的区位选择方面的研究,针对这些R&D机构行业选择方面的研究以及针对不同的行业的R&D机构的区位选择方面的比较分析的研究不多。跨国公司在华R&D机构的行业分布是其跨国公司内在的投资动机和我国各行业的特征的因素共同决定的；同时针对不同的行业而言,其在华的区位分布又是我国各地区的外在环境因素决定的。本文借鉴相关领域研究成果,从内在和外在因素两个方面论述了基于跨国公司在华R&D行业角度的区位选择问题。首先,对跨国公司在华R&D投资的行业分布的现状进行了分析。然后,从内在因素的层面分析了跨国公司在华设立R&D机构的行业决定因素,分别从辅助生产、寻求资源、开拓市场三个方面探讨其动机,从选择的行业在华的竞争程度、跨国公司在华R&D机构的行业跟进行为两个方面其行业选择行为,并由此概括出跨国公司在华R&D行业选择的一般模式。其次,基于跨国公司在华R&D机构的主要行业分布,从我国各地区投资环境的角度实证分析了影响跨国公司在华R&D机构区位分布的主要因素,并进行了不同行业之问的比较分析。最后,基于实证分析结果提出相应的政策建议。